Les acides aminés naturels

Les acides aminés naturels. Il sont au nombre de 20.D 

Nom

Code 3 lettres

Code 1 lettre

Propriétés

Formule 2D

Masse moléculaire Da 

Volume spécifique cm3/g

% dans les protéines

pI à 25 ºC

Coordonnées atomiques

Image ("Plug in" chime)

Alanine

Ala

A

aliphatique
hydrophobe
neutre

 

89 

0,74

7,61

6.107

ala.pdb

Arginine

Arg

R

polaire
hydrophile
chargé (+)

174

0,70

5,19

10.76

arg.pdb

Asparagine

Asn

N

polaire
hydrophile
neutre

132

0,62

4,36

-

asn.pdb

Aspartate

Asp

D

polaire
hydrophile
chargé (-)

133

0,60

5,25

2.98

asp.pdb

Cystéine

Cys

C

polaire
hydrophobe
neutre

121

0,63

1,63

5.02

cys.pdb

Glutamine

Gln

Q

polaire
hydrophile
neutre

146

0,67

3,93

-

gln.pdb

Glutamate

Glu

E

polaire
hydrophile
chargé (-)

147

0,66

6,47

3.08

glu.pdb

Glycine

Gly

G

aliphatique
neutre

75

0,64

6,85

6.064

gly.pdb

Histidine

His

H

aromatique
polaire
hydrophile
chargé (+)

155

0,67

2,24

7.64

his.pdb

Isoleucine

Ile

I

aliphatique
hydrophobe
neutre

131

0,90

5,85

6.038

ile.pdb

Leucine

Leu

L

aliphatique
hydrophobe
neutre

131

0,90

9,53

6.036

leu.pdb

Lysine

Lys

K

polaire
hydrophile
chargé (+)

146

0,82

5,97

9.47

lys.pdb

Méthionine

Met

M

hydrophobe
neutre

149

0,75

2,37

5.74

met.pdb

Phénylalanine

Phe

F

aromatique
hydrophobe
neutre

Absorbance lm=257,4nm e=197M-1cm-1

165

0,77

4,10

5.91

phe.pdb

Proline

Pro

P

hydrophobe
neutre

115

0,76

4,89

6.3

pro.pdb

Sérine

Ser

S

polaire
hydrophile
neutre

105

0,63

7,08

5.68

ser.pdb

Thréonine

Thr

T

polaire
hydrophile
neutre

119

0,70

5,58

-

thr.pdb

Tryptophane

Trp

W

aromatique
hydrophobe
neutre

Absorbance lm=279,8nm e=5600M-1cm-1

204

0,74

1,21

5.88

trp.pdb

Tyrosine

Tyr

Y

aromatique
polaire
hydrophobe

Absorbance lm=274,6nm e=1420M-1cm-1

181

0,71

3,16

5.63

tyr.pdb

Valine

Val

V

aliphatique
hydrophobe
neutre

117

0,86

6,61

6.002

val.pdb

* pourcentage calculé sur la banque de données SWISS-PROT 40.0